Pour favoriser encore un peu plus la diffusion du générique, l'Assurance maladie a aussi mis en place le mécanisme "tiers payant contre génériques".

Rappelons que le tiers payant permet à l'assuré la dispense des frais qui vont lui être remboursés, pour en bénéficier l'assuré doit présenter sa carte vitale, et le cas échéant sa carte de mutuelle.

Le tiers payant est proposé  dans les pharmacies pour la part des assurance maladie, ou même avec certaines mutuelles pour la part complémentaire santé. À défaut de tiers payant, le consommateur doit retourner la feuille de soin à sa CPAM,  il obtiendra ensuite ses remboursements (compter 2 jours de délais entre le remboursement assurance maladie et le remboursement de votre mutuelle santé habituellement).

Pour encourager la consommation de génériques, l'assurance maladie a décidé de subordonner le tiers-payant, à l'acceptation du générique quant il existe. Si le patient refuse que le pharmacien substitue un générique au médicament de marque figurant sur l'ordonnance, il doit alors faire l'avance des frais et se faire ensuite rembourser par sa caisse d'Assurance Maladie.

Avec aujourd'hui près de 75 départements français l'appliquant (contre 22 fin 2007), le dispositif est en passe d'être en passe d'être généralisé à toutes la France dans les mois à venir.