Il s'agit de la somme dont le versement à pour effet de maintenir le bénéfice d'une complémentaire santé. Les cotisations sont calculées pour pouvoir faire face au coût des sinistres survenus dans l'année et à tous les frais liés à la gestion des mutuelles.

Les cotisations peuvent être revalorisées chaque années selon des modalités différentes (basées sur l'indexation pour les complémentaires santé relevant du code des assurances, qui par rapport aux mutuelles santé ont moins de liberté sur le sujet).

Ajoutons qu'une nouvelle législation, voire l'imposition d'une nouvelle taxe ont aussi pour effet d'augmenter les cotisations des assurés :
Ainsi pour ne prendre qu'un exemple, la décision du gouvernement de mettre en place une taxe sur le chiffre d'affaires des complémentaires santé va conduire de nombreuses mutuelles santé (pour celles qui ne l'ont pas encore fait) à réévaluer le montant de leurs cotisations dans les prochains mois, au grand dam des assurés.